KrakenSmith — pipeline para bancos customizados (Kraken2 & Bracken)
Instalação, construção de bancos, classificação e visualização (Krona).
Bioinformática • Genômica • Python
Análises Metagenômicas, Pipelines e Visualização de Dados
Sou bioinformata focado em metagenômica, variantes genéticas e automações. Aqui você encontra projetos, tutoriais e um pouco sobre mim.
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Sobre mim
Bacharel em Ciências Biológicas e Mestre em Ciências (ênfase em genética, mutações e terapia gênica, 2020). Atualmente sou doutorando em Ciências Farmacêuticas pela UNICENTRO, vinculado ao projeto Genomas Paraná. Tenho experiência sólida em genética molecular, citogenética, análises clínicas, terapia celular e medicina regenerativa com células-tronco mesenquimais.
Atuo também na área de bioinformática aplicada à genômica e metagenômica, com foco em análises de microbiomas, anotação de genomas bacterianos e identificação de genes de resistência antimicrobiana. Desenvolvo e aplico pipelines automatizados que abrangem desde o pré-processamento de dados de sequenciamento até montagem, anotação funcional e visualização de genomas, utilizando R, Python e Bash em ambiente Linux.
Tenho ainda familiaridade com bancos de dados relacionais (PostgreSQL, MySQL) e desenvolvimento de soluções web. Sou proficiente no uso do Google Planilhas, explorando recursos avançados para automação, cruzamento e análise de dados de forma visual e integrada.
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